一艘在大西洋上航行的邮轮出现汉坦病毒感染相关聚集性疫情,引发全球关注。根据世界卫生组织通报,截至5月12日已经收到11例相关病例的报告,其中3例死亡,所有11例病例均为船上乘客或船员。11例中有9例为确诊病例,另外2例为疑似病例。数智化转型网www.szhzxw.cn
那么,我国境内有无安第斯病毒传播的风险?根据5月9日央视网消息,中国疾控中心病毒病所副所长王世文表示,在我国,没有引发本次邮轮疫情的安第斯(汉坦)病毒的传播,也没有发现能够携带并传播该类病毒的宿主动物,安第斯(汉坦)病毒输入我国的风险极低,引发暴发或聚集性疫情的风险极低。
汉坦病毒是一组主要由啮齿动物携带的病毒,属于布尼亚病毒纲、汉坦病毒科、正汉坦病毒属。本次邮轮疫情的元凶是能人际传播的安第斯型汉坦病毒(Andes virus,ANDV)——汉坦病毒家族中唯一已知的、被证实可实现有限人传人的汉坦病毒。它潜伏期最长可达45天,感染者可在完全无症状的状态下跨区域活动;一旦发病,病情进展极快,可迅速引发急性呼吸窘迫综合征与休克,且目前全球尚无广泛上市的疫苗与特效抗病毒药物。数智化转型网www.szhzxw.cn
一、破局关键:宏基因组测序——病原检测的”火眼金睛”
宏基因组测序(mNGS)能够全域扫描、洞察未知,是病原检测的”火眼金睛”。
不同于传统检测”按图索骥”的逻辑,宏基因组测序采用”涸泽而渔”的策略。简单来说,传统PCR像是拿着一把特定的鱼钩去钓鱼,只能钓到你提前知道名字的鱼;而宏基因组测序则是撒下一张覆盖整个水域的大网,把水里所有的生物一网打尽,再去庞大的基因数据库里自动比对。数智化转型网www.szhzxw.cn
这种技术特征让它在突发公共卫生事件中具备三大不可替代的核心价值:
(一)前置预警:在症状出现前捕捉病毒踪迹
宏基因组测序可检测邮轮废水、空调滤网、高频接触表面等环境样本,在首位感染者症状出现前捕捉到病毒的核酸信号,提前拉响警报,将疫情阻断在萌芽状态。
(二)精准溯源:破译病毒的”基因行程码”
每一种病毒基因组序列是独一无二的”身份证”,通过全基因组测序比对,能精准判定病毒种类和亚型,追溯地理来源、重建传播链条,明确区分鼠源性或人际传播。数智化转型网www.szhzxw.cn
(三)发现未知:应对未知病原体的”秘密武器”
面对人类从未见过的X病原体,宏基因组测序可直接呈现其完整基因序列,让科学家第一时间认识它的结构、特性和传播能力,为后续的诊断、治疗和防控争取宝贵时间。值得一提的是,早在2019年12月,华大智造便凭借该技术率先发现新冠病毒基因组,为全球防控赢得关键窗口期。
本次安第斯病毒邮轮疫情表明,在人员密集、来源复杂、病原体多样化的移动环境中,往往难以提前发现隐匿的病原威胁。因此,不能仅依赖症状出现后的被动响应,而需建立基于环境样本的前置预警机制。数智化转型网www.szhzxw.cn
卫生部门定期对污水处理系统的污水样本进行宏基因组测序分析,可一次性检出样本中的多种已知甚至未知的病原微生物序列,例如基孔肯雅病毒、尼帕病毒、季节性流感病毒等。在第一位感染者出现症状之前,便能”先发制人”,阻断后续的接触传播。将污水监测纳入常态化卫生管理,可显著提升对突发传染病的早期感知能力。
二、全域扫描:华大智造”长枪短炮”锁定病毒”行程码”
面对本次邮轮疫情这类”病原体未知、传播途径复杂”的突发公共卫生事件,华大智造可为汉坦病毒的监测与防控同时提供短读长(DNBSEQ)和长读长(CycloneSEQ)的宏基因组测序方案,从全域筛查到精准溯源,为汉坦病毒的快速诊断、疫情追踪与防控决策提供从样本处理到分析报告端到端的全链条技术支撑。数智化转型网www.szhzxw.cn
(一)RNA病原微生物宏基因组测序方案四大核心优势
01 无需预设靶标,覆盖已知与未知病原:采用MGIEasy Fast RNA文库制备试剂套装,无需设计特异性引物,即可对样本中的全部核酸进行非偏好性捕获和测序。不仅能准确识别汉坦病毒,还可同步检出基孔肯雅病毒、尼帕病毒、季节性流感等其他潜在病原体,避免混合感染漏诊,为传播链回溯提供完整的微生物组数据全景。针对邮轮这类人员密集、来源复杂、病原体多样化的移动环境,可通过定期对污水处理系统的污水样本进行宏基因组测序分析,在第一位感染者出现症状前”先发制人”,阻断后续接触传播,将被动响应转变为前置预警。数智化转型网www.szhzxw.cn
02 搭配DNBSEQ平台,全流程自动化,满足大规模监控需求:覆盖”核酸提取-建库-测序-分析”全流程,核酸提取和文库制备环节可通过SP-100RS自动化样本制备系统实现,显著减少人工操作误差与负担,平衡检测效率与成本。
03 配套生信分析工具,快速锁定病原高效溯源:配套微生物快速识别平台(PFI)与微生物组装溯源软件(MGAP),可高效完成数据质控、病原鉴定、基因组组装与功能注释。其中PFI平台支持未知病原的快速筛查与鉴定,大幅缩短疑似病例的确诊周期;MGAP软件可实现汉坦病毒全基因组高精度组装,助力变异位点分析、株系分型及溯源研究。数智化转型网www.szhzxw.cn
04 丰富实战经验,保障检测可靠性:该方案已在基孔肯雅热、猴痘、新冠、鹦鹉热等多起突发公共卫生事件中得到实战验证,曾助力国家疾控和地方疾控完成多例未知病原鉴定与溯源。依托成熟的技术体系与海量数据积累,在如海关口岸、疾控溯源、临床诊断等更广泛的公共卫生领域,它同样发挥着”全域扫描”的作用,为疫情防控、精准诊断提供稳定、准确的关键线索。
(二)CycloneSEQ宏基因组测序整体解决方案
CycloneSEQ宏基因组测序整体解决方案,采用长读长测序技术,可为汉坦病毒等罕见病原的快速确诊与精准治疗提供关键技术支撑:
- 完整基因组组装:能跨越DNA的重复区域,避免”碎片化”的困扰。
- 实时检测:数据实时采集,即时输出,适用于应急检测等高时效性场景。
- 便携灵活:设备小巧,可实现现场测序,大幅缩短样本转运时间。
从新冠驰援到猴痘防控,从基孔肯雅热监测到尼帕病毒应急响应,华大智造始终以”创新智造引领生命科技”为理念,凭借全球首个大规模商业量产级短读长+长读长测序平台优势,持续为全球公共卫生体系提供核心工具支撑。未来,华大智造仍将致力于满足病原微生物全基因组测序、靶向测序和宏基因组测序全流程等应用场景的需求,用科技力量筑牢全球生命健康防线。数智化转型网www.szhzxw.cn
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